魯智深后期疏遠林沖的原因有幾個可能的解釋。首先,根據文獻[1]和文獻[2]的內容,林沖在野豬林時無意中透露了魯智深的身份,這使得魯智深懷疑林沖出賣了他的來歷。盡管林沖并非故意,但這一事件導致了魯智深對林沖的疏遠。其次,根據文獻[3]和文獻[4]的內容,魯智深和林沖在梁山上的職務不同,導致他們并肩作戰的機會減少,接觸的機會變少。此外,宋江對高級頭領之間走得太近持謹慎態度,擔心林沖和魯智深搞小團體,分裂梁山組織,因此限制了他們的交往。最后,根據文獻[8]和文獻[9]的內容,魯智深在重逢時更關心林沖的妻子的消息,而不是細細詢問兄弟的境況,這使得林沖感到懷疑和疏遠。綜上所述,魯智深后期疏遠林沖可能是由于林沖無意透露了魯智深的身份,職務不同導致接觸減少,宋江的忌諱以及魯智深對林沖的關心不如以前所致。